Филиал «Аэронавигация Западной Сибири» объединяет 6 центров обслуживания воздушного движения (Новосибирский, Алтайский, Омский, Кузбасский, Томский и Стрежевской) и региональный центр Единой системы организации воздушного движения (Новосибирск), сформированный на базе Новосибирского зонального центра ЕС ОрВД и Новосибирского районного центра ЕС ОрВД. Региональный центр ЕС ОрВД (Новосибирск) обеспечивает обслуживание воздушного движения в верхнем воздушном пространстве над всей территорией, входящей в зону ответственности филиала. На базе Томского центра ОВД создан Центр полетно-информационного обслуживания (ПИО) в нижнем воздушном пространстве над равнинной частью территории филиала.

В воздушном пространстве центров ОВД филиала находятся 78 участков международных воздушных трасс, 7 участков воздушных трасс федерального значения и 11 маршрутов зональной навигации общей протяженностью более 55 тыс. км.

Аэронавигация Западной Сибири осуществляет обслуживание воздушного движения на девяти аэродромах, из них семь имеют федеральное значение и два − региональное. Шесть аэродромов открыты для выполнения международных полетов. В зоне ответственности филиала также расположены два аэродрома государственной авиации, более 162 посадочных площадок и один вертодром.

В целях обеспечения качественного аэронавигационного обслуживания руководство филиала уделяет особое внимание модернизации и техническому перевооружению радиотехнических средств обеспечения полетов, оптимизации производственных процессов с применением современных технологий.

Филиал укомплектован высококвалифицированными кадрами. Ежедневно через зону ответственности филиала выполняется до 1500 воздушных судов полетов, безопасность движения которых обеспечивают более 1600 специалистов и руководителей подразделений с применением свыше 100 объектов РТОП и 1700 единиц радиотехнического оборудования.